27 ऑक्टोबर रोजी, एटीएसने बंदी घातलेले अल कायदा साहित्य बाळगल्याच्या आरोपावरून आयटी फर्मचे सॉफ्टवेअर अभियंता आणि कोंढवा येथील रहिवासी हंगरगेकर यांना अटक केली. त्याच्यावर बेकायदेशीर क्रियाकलाप (प्रतिबंध) कायदा (UAPA) अंतर्गत अल-कायदा इन इंडिया सबकॉन्टिनेंट (AQIS) या दहशतवादी संघटनेच्या समर्थनार्थ जिहादचा प्रचार करून देशाची एकता आणि सुरक्षा धोक्यात आणल्याचा आरोप ठेवण्यात आला आहे, ज्यात तपासकर्त्यांना एकूण 30 दिवसांची पोलीस कोठडी देण्यात आली आहे.16 नोव्हेंबरपर्यंत एटीएस कोठडीत त्याच्या प्राथमिक कोठडीनंतर, एटीएसने हंगरगेकरला न्यायालयीन कोठडीत ठेवण्याची शिफारस केली होती, त्याच्या डिजिटल उपकरणांचे फॉरेन्सिक विश्लेषण सुरू असल्याने योग्य वेळी त्याच्या एटीएस कोठडीतील उर्वरित 11 दिवस मिळविण्याचा अधिकार राखून ठेवला होता.त्याच्या इलेक्ट्रॉनिक उपकरणांच्या विश्लेषणातून आलेल्या ताज्या माहितीच्या पार्श्वभूमीवर, एटीएसने हंगरगेकरला बुधवारी विशेष न्यायालयात हजर केले आणि त्याच्या 11 दिवसांच्या कोठडीची मागणी केली. न्यायालयाने त्याला ३ जानेवारीपर्यंत एटीएस कोठडीत ठेवण्याचे आदेश दिले. रिमांड ग्राउंडमध्ये असेही म्हटले आहे की त्याच्या साथीदाराच्या इलेक्ट्रॉनिक उपकरणांमधून जप्त केलेल्या डेटाच्या विश्लेषणादरम्यान आक्षेपार्ह माहिती आढळली, तो देखील संशयित आहे. या निष्कर्षांच्या संदर्भात आरोपींची आणखी चौकशी करणे आवश्यक असल्याचे फिर्यादी पक्षाने सादर केले.
